税務相互相談会の皆さん
下記について教えて下さい。

【税　　目】

所得税＜申告所得税・源泉所得税＞（山形富夫税理士）

【対象顧客】

個人

【前　　提】

・コンサルティング会社です。
・役員構成は、代表取締役1名、使用人兼務役員2名で、従業員は13名です。
・株主、役員および従業員の中に、代表取締役以外の親族はおりません。
・日当規程については、約10年前に前職の規程を参考に作成し、
　以降、社内で継続して運用しております。

【質　　問】

日当規定について、過去2024年1月から2026年6月まで遡って確認。

これまで一部曖昧となっていた支給ルールを明確化し、
対象となる出張や支給額を改めて精査・修正。

その結果、役員（代表取締役含む）および従業員の計10名について、
会社から追加で支給する金額と、本人から会社へ返金してもらう金額が
それぞれ発生しました。

こちらの内容で過去の日当支給額との差額の精算処理をしても
税務調査で否認されるリスクはないのでしょうか？

仮に、精算処理をした場合の会計処理について、

追加で役員・従業員へ支給する金額は、日当として「旅費交通費」（損金）で処理し、
会社へ返金される金額は「雑収入」（益金）で処理し調査時に問題ないのでしょうか？

あわせて、会社への返金分の消費税区分は「課税売上」となる認識でよろしいでしょうか？